|
|
Taxonomický přehled rodu Arthroderma se zaměřením na druhy izolované z plazů a netopýrů
Kolarczyková, Daniela ; Hubka, Vít (vedoucí práce) ; Dobiáš, Radim (oponent)
Rod Arthroderma patří do skupiny geofilních dermatofytů, které primárně rozkládají keratin v půdě a příležitostně působí infekce u člověka a zvířat. Tomuto druhově bohatému rodu byla v minulých letech věnována pozornost zejména z hlediska druhů vyskytujících se v lidském klinickém materiálu, nebo klinických vzorcích odebraných z hlodavců a dalších savců, což bylo spojeno s výrazným nárustem počtu jeho druhů. V této diplomové práci byla prozkoumána druhová diverzitu rodu Arthroderma v materiálu izolovaného z hadů, netopýrů a jeskynního sedimentu, což je dosud téměř neprobádaný substrát z hlediska výskytu tohoto rodu. Zkoumané kmeny byly izolovány během výzkumu onemocněné netopýrů "white nose syndromu" a hadů "snake fungal disease". Rod Arthroderma byl v minulosti zkoumán jako celek buď pouze na základě morfologie nebo po nástupu molekulárních metod z hlediska mnohagenové fylogeneze. Žádná monografie však nekombinovala současně fenotypová a molekulárně-genetická kritéria pro hodnocení druhových hranic napříč rodem nebo jeho významnou částí. I to je jedním z důvodů, proč jsou hranice druhů často nejasně definované. Dalším z cílů této práce bylo tedy zdokonalit mnohagenovou fylogenezi rodu začleněním nových kmenů, nově popsaných druhů a doplněním chybějících sekvenčních dat. Pro revizi druhových hranic...
|
|
|
Elucidating the evolution and diversity of colonial chrysophytes
Pusztai, Martin ; Škaloud, Pavel (vedoucí práce) ; Siver, Peter (oponent) ; Gusev, Evgeniy S. (oponent)
Současný stupeň poznání diverzity zlativek bohužel stále stojí převážně na tradičních popisech morfodruhů. Trvalým problémem pak je neexistence sekvenačních dat pro většinu těchto druhů. Z toho mimo jiné plyne, že po celém fylogenetickém stromu zlativek je rozptýleno několik běžných morfotypů (Ochromonas-like aj.). Je zřejmé, že aktuální taxonomie třídy a obsáhnutá diverzita rozhodně neodráží skutečné druhové bohatství zlativek. Navíc nedávné studie zaměřené na zlativky s křemičitými šupinami (Mallomonas, Paraphysomonas, Synura) jednoznačně ukázaly, že problematika (pseudo)kryptických druhů je běžným fenoménem i pro taxony s relativně dobrým konceptem (s využitím SEM/TEM ultrastruktury). Typická zlativka nicméně vypadá jako nahý bičíkovec, jehož jedinou pevnou strukturou v rámci životního cyklu je stomatocysta. Zatímco jednobuněční bičíkovci Ochromonas a Spumella byli nedávno podrobeni taxonomické revizi s využitím technik molekulární genetiky, koloniální bičíkovci s Uroglena-like morfotypem nikoliv. Hlavním cílem této práce proto bylo podrobit široce rozšířené koloniální zlativky s morfotypem Synura s.l. a Uroglena s.l., které způsobují nápadné sezónní populační boomy (vodní květy), moderní taxonomické revizi na základě znalosti jejich molekulární fylogeneze, morfologie/ultrastruktury a ekologie....
|
|
|
Unveiling hidden species diversity in desmids (Desmidiales, Viridiplantae)
Šťastný, Jan ; Neustupa, Jiří (vedoucí práce) ; F.M. Coesel, Peter (oponent) ; Kaštovský, Jan (oponent)
Krásivkové druhy byly tradi n vymezovány pouze na základ morfologických znak . Ov em astý chybný výklad morfologické variability u krásivek vedl v minulosti ke zna ným zmatk m v taxonomii této významné skupiny zelených as, co komplikuje interpretace krásivkové biodiverzity v kontextu sladkovodní ekologie, biogeografie a biomonitoringu. Proto jsem se v rámci této práce zam il p edev ím na doposud opomíjené téma, vyu ití polyfázického p ístupu pro výzkum taxonomie krásivek na druhové úrovni. Ve v t in studií byla pro zhodnocení taxonomie vybraných druh krásivek (zejména zástupc tvarov komplexních rod Micrasterias a Xanthidium) vyu ita kombinace jak tradi ních morfologických, tak i moderních fylogenetických a geometricko-morfometrických metod. Ve dvou láncích jsem pro vyjasn ní taxonomie n kolika tvarov mén nápadných krásivek pou il kombinaci tradi ních morfologických dat a dat o autekologii p íslu ných druh . Obecn , výsledky této práce ukázaly, e zp sob, jakým recentn nahlí íme na diverzitu a roz í ení krásivek, by m l být od základu zm n n. Reálná druhová diverzita je ve v t in p ípad z eteln jemn j í ne ta, definovaná pouze na základ klasických morfologických p ístup , asto je na úrovni variet t chto tradi ních morfologicky definovaných druh a lze ji v t inou dob e popsat pomocí kombinace...
|
|
|
Polyphasic approach to the taxonomy of selected cyanobacteria
MAREŠ, Jan
Moderní taxonomická revize sinic nebyla dosud dokončena a skýta řadu teoretických i praktických úskalí. Tato disertační práce se zabývala výzkumem vybraných taxonů terestrických sinic s využitím polyfázického přístupu, který je založen na molekulární fylogenetické analýze doporovázené fenotypovou charakterizací a nomenklatorickým ošetřením. Byly využity rozmanité metodické přístupy včetně optické a transmisní elektronové mikroskopie, molekulární analýzy (sekvenování DNA) kmenů sinic, jednotlivých buněk a vláken, a fylogenetické analýzy několika genomových úseků. Tato studie předtsavila systematickou revizi jednotlivých rodů sinic i celého tohoto kmene organismů, a poskytla návrhy pro navazující výzkumné projekty.
|
host ::
RSS.